TrayMix S2

TrayMixTM S2
Station d'hybridation automatisée

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Description

Accélérez vos travaux de recherche et obtenez de meilleurs résultats avec la station d'hybridation entièrement automatisée TrayMix™S2.

      La station d'hybridation TrayMix™ S2 est un système de micro mélangeur basé sur une technologie Breveté de l'Advection Chaotique "Active mixing" dont BioTray®est propriétaire.

De meilleurs résultats sont obtenus par une dispersion homogène des molécules sur l'ensemble de la zone d'hybridation (21 x 60 mmm). Le système réduit de façon significative les temps d'hybridation, tout en offrant des résultats reproductibles et faibles d'une expérimentation à une autre et en utilisant de faible quantité de cibles  (5pmole) marquées ou non.
Une plus grand spécificité d'hybridation est atteinte (forte réduction des bruits de fond, intensification de la fluorescence) tout en réduisant de moitié le coefficient de variation (CV). Tous les phénomènes fluidiques tels que les zones mortes et les bulles que l'on peut trouver avec le systèmes classiques actuels sont supprimés afin de vous permettre de réussir toutes vos hybridations en un seul protocole.

Grace à son logiciel de pilotage intuitif et simple d'utilisation,  WinTrayMix™, le système ne nécessite pas de mains d'experts. TrayMix™ permet de réaliser toutes les étapes anté et post-hybridation: pré-hybridation, hybridation et lavages. Deux modes de travail sont proposés: mode routine pour les hôpitaux et mode expert pour les laboratoires de recherche.

Avec la station d'hybridation TrayMix™ S2, améliorez vos résultats d'analyses pour l'expression de gènes, détection de mutations, l'hybridation Génomique Comparative (CGH), génotypage, FISH, et plus encore...

Référence Description
 HS-TMX_S2  Station d'hybridation TrayMix™ S2 (2 lames)
 Un an de garantie pièce et main d'oeuvre.
 Un an de mise à jour du logiciel WinTrayMix™, Support technique.

Télécharger la brochure TrayMix™ S2

Spécifications

La température est régulée de l'ambiante à 75°C +/- 0,1°C. En amont de la boucle microfluidique et de la chambre d'hybridation, un collecteur à 5 voies distribue les solutions sélectionnées auparavant par la programmation.

Les étapes de pré-hybridation, d'hybridation, des lavage et de décontamination sont tous programmables.
L'étape de séchage se fait en dehors du système avec notre mini centrifugeuse. La force centrifuge est le système le plus performant pour éliminer l'humidité résiduelle, permettant d'obtenir des résultats de qualité. L'utilisation de gaz à sec a précisément été évités pour supprimer la formation de taches causées par le séchage des lames avec les gaz sous pression.


Caracteristiques
 

 Dimensions: L x P x H

 35 cm x 26.5 cm x 14 cm

 Capacité

 2 Lames

 Format des lames

 25 mm x 76 mm x 1 mm (1" x 3")

 Zone d'hybridation

Zone d'hybridation: 21 x 60 mm  

 Volume d'hybridation

 Chambre d'hybridation: 50 µl
 Boucle microfluidique: 450 µl

 Chambre d'hybridation

Spécialement conçu pour maintenir une réaction des volumes d'hybridation via un système mécanique (cales).
BioTray® garantie un volume indentique d'une hybridation à une autre.
Bien que les joints en élastomers sont utilisés pour assurer l'étanchéité de la chambre, ils ne définissent pas le volume de la chambre d'hybridation.

 Cibles Biologiques

 Quantitée: de 5 à 50 pmol injecté à la pipette: jusqu'à 50 μL

 Température

 Régulation: 20°C - 75°C (+/- 0,1°C)

 Tampons & Solutions

 Chimiquement résistant à la quasi-totalité des réactifs

 Programmation

 PC + logiciel BioTray® "WinTrayMix™"
Système d'exploitation: Windows XP / Vista

 Flexibilité

Par le biais de l'automatisation et du logiciel simple d'utilisation WinTrayMix™.
Le port d'injection est directement relié à la chambre, de ce fait des procédures spécifiques peuvent être mises en œuvre y compris les multiples hybridations, les réactions enzymatiques et bien d'autres...

 Reproductibilité

 Le système ne nécessite pas de « mains d'experts ».

Cette technologie permet d'avoir une bonne reproductibilité des tâches, difficilement atteignable manuellement.

Système automatisé

 Mélange Actif avec un volume d'hybridation contrôlé.
Automatisation de chaque étape du protocole d’hybridation (pré-hybridation, hybridation, jusqu’à 3 lavages) ainsi que la décontamination de la chambre et de la boucle fluidique.

Rentabilité
&
Compatibilité

 Peu de maintenance nécessaire.
Tampons et solutions compatibles disponibles chez tous les fournisseurs.


Fig.1 Fig.2

Fig.1: La station d'hybridation TrayMix™ S2 dispose de deux chambres totalement indépendantes. Ainsi elles peuvent être programmées pour exécuter le même protocole ou des protocoles totalement différents, pilotés grâce au logiciel WinTrayMix. Cette flexibilité permet à l'opérateur d'effectuer différentes hybridations sur chaque chambre.

Fig.2: Une fois le système programmé et la biopuce insérée, le tampon d’hybridation est automatiquement acheminé dans la chambre d'hybridation qui est composée d'une plate-forme sur laquelle est positionnée la lame et d’une chambre d’une hauteur de 50 µm. Le volume de la chambre est fixé mécaniquement. Le joint en élastomère perfluoré assure uniquement l'étanchéité de la chambre.

Fig.3: Port d'injection
Fig.3: La version actuelle permet d'introduire jusqu'à 60 µL de solution cible dans la chambre d'hybridation, par l'intermédiaire du port d'injection. Pendant l'hybridation, le port d'injection est fermé ce qui empêche toute évaporation. Le système du port d'injection de cibles permet de chasser toutes les bulles qui se sont logées dans la chambre et la boucle microfluidique. Cette opération est réalisée automatiquement lorsqu'un programme est lancé.

Logiciel


WinTrayMix™ est un logiciel complet qui allie puissance et simplicité d'utilisation avec une interface très intuitive. Conçu pour les utilisateurs de microarrays, il offre les fonctionnalités suivantes :
  • Deux modes de programmation sont proposés: mode routine pour les hôpitaux et expert pour les laboratoires de recherche.

  • Sauvegarde des protocoles pour une utilisation ultérieure

  • Indépendance des différentes étapes: pré-hybridation, hybridation, lavage et décontamination du système. Chaque étapes peut s'effectuer successivement ou séparement.

  • Traçabilité des opérations et édition d'un rapport complet au format HTML.

Fig 1 : Interface d'accueil

Fig.1: Interface d'accueil. L'interface d'accueil montre toutes les chambres de la station d'hybridation. Il est possible de choisir le nombre de chambres ultérieurement. L'opérateur a ainsi le choix de travailler en mode routine ou expert avant de paramètrer les protocoles d'hybridation. La deuxième barre de défilement montre la progression de chaque étape et celle du haut montre la progression total des programmations .

Fig 2 : Mode de Travail

Fig.2: Lorsque vous démarrer la communication avec l'appareil, vous choisissez votre mode de travail "Routine ou Expert" et sélectionnez les chambres avec lesquelles vous voulez travailler.
L'interface du logiciel WinTrayMix vous propose quatres procédures d'utilisation en mode "Routine" et cinq en mode "Expert".

Fig 3 : Configuration de la Station

Fig.3: cette interface montre toutes les configurations possibles avec la station d'hybridation TrayMix™. Les protocoles de chaque étapes sont paramètrables. Sur la partie droite, l'opérateur entre les paramètres de température et de temps.

Fig 4: 3 Etapes de Lavage

Fig.4: Le système permet de programmer jusqu'à 3 étapes de lavages. Il est possible de rappeler "n" fois chaque étapes de lavages pour régénérer les tampons. Chaque lavage n'utilise que 500µL de solutions.

Fig.5 Fig.6

Fig.5 & Fig.6: Toutes les étapes d'une programmation sont visualisables sur la fenètre. A tout moment au cours du process, l'opérateur peut suivre le temps d'avancement de toute la programmation ainsi que l'étape en cours. Pour l'étape d'hybridation un décompte (heures, minutes) apparait entre les barres de progression.

hyb_icone.jpgLa procédure d'Hybridation vous permet de sélectionner, paramètrer et programmer les différentes opérations à la pré-hybridation, l'hybridation et les lavages.

decontamination_icone.jpgLa procédure de Décontamination vous permet de nettoyer et décontaminer le système. Cette procédure doit être réalisée entre chaque procédure d'hybridation un minimum de 3 fois à 60°C.
La procédure de Maintenance permet d'initialiser, vider et changer vos réactifs.

maintenance_icone.jpgLa procédure Chronogrammes "Step by Step" en mode expert, permet de faire les étapes une par une de la procédure d'hybridation. Il est ainsi possible de réaliser des hybridation avec plusieurs temps et températures différentes.

report_icone.jpgRapport d'hybridation : WinTrayMix permet d'éditer un rapport concernant d'hybridation.
Le rapport est personnalisé avec les caractéristiques de votre expérience et le logo de votre organisme.
Le rapport généré par le WinTrayMix est un fichier HTML que vous pouvez lire avec n'importe quel navigateur web. Il comprend la date à laquelle il a été généré, les données de votre configuration, et résume dans un tableau les opérations effectuées.
Dans ce tableau, seules les opérations que vous avez paramétrées apparaissent : dénaturation, pré-hybridation, hybridation et/ou lavages. Pour chaque opération figurent la date et l'heure de début, la durée paramétrée et la durée réelle de l'opération, la température associée ainsi que le statut de l’opération (terminée, annulée ou sautée).


Technologie


Nos stations d'hybridation utilisent une technolgie de mélange actif éprouvée et brevetée dont BioTray® est propriétaire. Cette technologie est basé sur un phénomène dit d'"Advection Chaotique".
Une étude comparative entre l'hybridation dynamique dite par advection Chaotique et l'hybridation statique (manuelle) a été realisée et montre les aspects suivants:

Signal & CV (Coefficient de variation):

Ici la comparaison montre une meilleure intensité du signal en 2 heures avec la station d'hybridation TrayMix contre 12 heures en statique (manuel). De plus les coefficients de variation (CV) n'augmentent pas lors d'une hybridation avec la station d'hybridation TrayMix. Il est de 10% contre 30 % entre lames et lamelles.

Table1: Valeurs moyennes de fluorescence et de coefficient de variation (CV) mesurés sous différentes conditions d'hybridation (2 heures d'hybridation).

Concentration
Echantillon (0.1µM)
Volume
Solution (µl)
Quantité
échantillon (pmol)
Méthode Solution d'hybridation Taux de Fluorescence CV
Hybridation Statique 50 5 Entre lame et lamelle Non homogène 5500 0.33
Hybridation Dynamique 500 50 TrayMix™ Homongène 11 823 0.17

Table 2: Valeurs moyennes de fluorescence et de CV obtenus avec la même quantité de cibles, en statique et en dynamique respectivement (2 heures d'hybridation).

Quantité
Echantillon: 5pmol
Volume
Solution (µl)
Concentration: 5µg Méthode Solution
d'hybridation
Taux de Fluorescence CV
Hybridation
Statique
50 0.1 Entre lame
et lamelle
Non
Homogène
5500 0.33
Hybridation
Dynamique
500 0.01 TrayMix™ Homogène 6452 0.16

NB: Le CV du système après 2 heures d'hybridation est équivalent à celle de l'hybridation manuelle effectuée en 12 heures.

• Rapport Signal /Bruit & pécificité:

La biopuce est hybridée pendant 2 heures avec un ADN simple brun (84 nt) marqué à la Cy3, complémentaire à l'allèle a. Les hybridations ont été effectuées avec 5 pmol de cibles en statique entre lames et lamelles et en dynamique avec le TrayMix™. L'allèle b est utilisé comme contrôle pour la spécificité d'hybridation. Pour chaque expérience, l'intensité des spots est analysée et comparée au bruit de fond local. Les résultats comparent l'intensité du signal de fluorescence Cy3 obtenu au bruit de fond pour l'allèle a (en noir) et l'allèle b (gris) pour trois expériences A+/-SD (Standard de Déviation).

Cette figure montre que la spécificité du rapport signal / bruit de fond (allèle a - barres noires) est augmentée de 3,5 à 4,2 dans les conditions d'une hybridation dynamique avec le TrayMix. Le rapport signal / bruit de fond (allèle b - barres grises) est légèrement réduit. Les comparaisons de résultats après 12 heures d'hybridation en statique sont encore plus favorables à la station d'hybridation TrayMix™ (données non représentées). Le mélange actif par advection chaotique renforce les résultats d'hybridation: diminution du temps, homogénéité et meilleur rapport signal / bruit de fond. De plus, l'automatisation de cette étape est cruciale pour une meilleure reproductibilité des résultats. Le système a donc été mis au point en vue d'atteindre des niveaux de reproductibilité indispensables pour le diagnostic. L'advection chaotique offre un avantage encore plus important, comparée à l'hybridation passive, lors de l'utilisation de molécules de haut poids moléculaire pour des applications telles que les CGHarrays.

• Conclusions & Perspectives:

Le TrayMix™ offre une véritable innovation pour augmenter l'efficacité, la sensibilité, la reproductibilité et la robustesse des hybridations. Le port d’injection est conçu pour permettre d’ajouter automatiquement et séquentiellement des petites quantités de nouveaux réactifs pour le traitement de pré ou de post-hybridation (par exemple : réactions enzymatiques, réactions chimiques, réactions sandwich, etc.…). Ceci permet la conception des processus les plus compliqués tels que l'élongation d'Oglio ou les réactions multi-étapes. De plus, la technologie permet l’adaptation à de multiples lames ou de multiples zones sur une même lame. Il doit être noté que la technologie du TrayMix™ est applicable à tous les types de microarrays comme, CHIP on Chip, protéine et peptide, CGH, et FISH. Ce vaste éventail d’applications fait du TrayMix™ un grand investissement pour n’importe quel utilisateur de microarrays.

Support Technique:

Pour toutes questions techniques, veuillez contacter Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. ou par Tel : +33(0)4 27 02 19 83.
 

Accessoires


Tissu TechniCloth®:

technicloth_traymix_s2.jpg Fig.1: Dans le cadre du nettoyage des stations  d’hybridation TrayMix™, des cassettes d’hybridation, ou toute autre partie métallique, BioTray® préconise l’utilisation des tissus TechniCloth®. Ce tissu, imbibé d’eau ultrapure, d’éthanol pur ou dilué, offrira un nettoyage propre, sans contaminations et sans peluches des surfaces nettoyées.
Fig.1
alphalite.jpg
Fig.2

Fig.2: Le tissu TechniCloth® est un tissu non tissé composé d’un mélange 55% cellulose et 45 % polyester. Cette composition combine les propriétés hautement absorbantes d’une fibre naturelle, la cellulose (bonne absorption d’eau et liquides), et la résistance d’une fibre synthétique, le polyester (absorption de liquides à base d’huiles et graisses). Développé pour une utilisation en salle blanche en milieu médical ou pharmaceutique, sa structure permet le nettoyage et l’essuyage de surfaces avec une libération minimum de particules contaminantes, et une compatibilité avec de nombreux solvants.

Deux formats vous sont proposés.

Format 6" x 6" (15 x 15 cm):
Conditionnement: sachet de 600 tissus. Pack de 2 sachets de 300.

Format 9" x 9" (23 x 23 cm).
Conditionnement: sachet de 300 tissus. Pack de 2 sachets de 150.
 

Joints d'étanchéités:

Pour assurer une efficacité optimale de la chambre d'hybridation en prévision de l'usure des joints d'étanchéité, BioTray® fournit un jeu de 12 joints toriques en élastomère.
Un joint torique est une boucle d'un élastomère avec une section de forme circulaire.

La station d'hybridation TrayMix™S2 utilise deux sortes de joints toriques:
• Un joint torique en Fluoroélastomère (FKM)pour la chambre d'hybridation:
Dimension: Ø 49,9 mm x 1,78 mm.
• Un joint torique en Ethylène Propylène Diène Monomère pour l'orifice d'injection des cibles:
Dimension: Ø 6,75 mm x 1,78 mm.

Références Désignation
TX 606- TechniCloth® Tissus de nettoyage pour chambre d'hybridation.
Format : 6’’x 6’’ (15 cm x 15 cm)
Conditionnement : sachet de 600 tissus ; pack contenant 2 sachets de 300 tissus chacun.
TX 609- TechniCloth® Tissus de nettoyage pour chambre d'hybridation.
Format : 9’’x 9’’ (23 cm x 23 cm)
Conditionnement : sachet de 300 tissus ; pack contenant 2 sachets de 150 tissus chacun.
JT-FKM Joint d'étanchéité: Ø 49,9 mm x 1,78 mm - Pack de 12 joints.
JT-EPDM Joint d'étanchéité: Ø 4 mm x 1,78 mm - Pack de 12 joints.