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| TrayMix S4 |
TrayMixTM S4Station d'hybridation automatisée
DescriptionOptimisez hybridations et lavages
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| Référence | Description |
| HS-TMX_S4 | Station d'hybridation pour biopuces TrayMix™ S4 (4 lames). Un an de garantie pièce et main d'oeuvre. Un an de mise à jour du logiciel WinTrayMix™, Support technique. |
Télécharger la brochure TrayMix™ S4
Spécifications
La température est régulée de l'ambiante à 75°C +/- 0,1°C permettant de réaliser des étapes de dénaturation. En amont de la boucle microfluidique et de la chambre d'hybridation, un collecteur à 5 voies distribue les solutions sélectionnées auparavant par la programmation.
Les étapes de dénaturation, de pré-hybridation, d'hybridation, de lavages et de décontamination sont toutes programmables.
L'étape de séchage se fait en dehors du système avec notre mini centrifugeuse. La force centrifuge est le système le plus performant pour éliminer l'humidité résiduelle, permettant d'obtenir des résultats de qualité. L'utilisation de gaz à sec a précisément été évités pour supprimer la formation de taches causées par le séchage des lames avec les gaz sous pression.
| Dimensions: L x P x H | 52,6 x 46,5 x 21 cm |
| Poids: | 19 Kg |
| Capacité: | 4 lames. Pilotage indépendant ou simultané. |
| Zone d'hybridation: | 21 x 60 mm |
| Volume d'hybridation: | Chambre d'hybridation: 60 µl Boucle microfluidique: 250 µl |
| Système fluidique: | Manifold + chambre + capillaires. Chimiquement résistant et compatible avec tous réactifs. |
| Cible biologique: | 5 à 50 pmoles injectées à la pipette. |
| Echantillon: | 5 µl à 60 µl |
| Température: | 25° à 75°C (+/-0,1°C) |
| Programmation: | Logiciel WinTrayMix™. (Programmation et pilotage des éléments fluidiques). Système d'exploitation: Windows XP & Vista. Modes de programmation: Routine & Expert. |
| Logiciel WinTrayMix™ | Sauvegarde et téléchargement des protocoles. 6 procédures automatiques et programmables: Dénaturation, Pré-hybridation, Hybridation, Lavages et Décontamination. Modes d'exécution des programmes: routine & expert. Traçabilité des opérations et éditon d'un rapport complet au format HTML. |
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| Fig.1: 4 Chambres d'hybridation |
Fig.1: La station d'hybridation TrayMix™ S4 dispose de 4 chambres totalement indépendantes. Ainsi elles peuvent être programmées pour exécuter le même protocole ou des protocoles totalement différents, pilotés grâce au logiciel WinTrayMix™. Cette flexibilité permet à l'opérateur d'effectuer différentes hybridations sur chaque chambre.
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| Fig.2: Insertion de la lame | Fig.3: Fermeture de la chambre |
Fig.2 & Fig.3: Une fois le système programmé et la biopuce insérée, le tampon d’hybridation est automatiquement acheminé dans la chambre d'hybridation qui est composée d'une plate-forme sur laquelle est positionnée la lame et d’une chambre d’une hauteur de 50 µm. Le volume de la chambre est fixé mécaniquement assurant ainsi le même volume sur toutes les chambres. Le joint en élastomère perfluoré assure uniquement l'étanchéité de la chambre sur le lame.
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| Fig.4: Bouchon | Fig.5: Port d'injection |
Fig.4 & Fig.5: Le trou d'injection est situé à l'exterieur de la chambre, directement dans la boucle microfluidique. Ce sytème assure un mélange rapide et plus homogène. La station d'hybridation TrayMix™ S4 permet de réaliser toutes les étapes suivantes automatiquement (Dénaturation, Pré-hybridation, Hybridation, Lavages et Décontamination).
Le système permet aussi de programmer plusieurs phases avec des températures et temps différents.
Après chaque protocole, un système automatisé permet de décontaminer la chambre et le sytème fluidique.
Logiciel
WinTrayMix™ est un logiciel complet qui allie puissance et simplicité d'utilisation avec une interface très intuitive. Conçu pour les utilisateurs de microarrays, il offre les fonctionnalités suivantes:
- Deux modes de programmation: mode routine pour les hôpitaux et expert pour les laboratoires de recherche.
- Sauvegarde des protocoles pour une utilisation ultérieure
- Indépendance des différentes étapes: Dénaturation, Pré-Hybridation, Hybridation, Lavages et décontamination du système. Les étapes peuvent être réalisées en continue ou étape par étape.
- Traçabilité des opérations et édition d'un rapport complet au format HTML.
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| Fig.1: Interface d'accueil |
Fig.1: Interface d'accueil. L'interface d'accueil montre toutes les chambres de la station d'hybridation. Il est possible de choisir le nombre de chambres à programmer. L'opérateur a ainsi le choix de travailler en mode routine ou expert avant de paramètrer les protocoles d'hybridation. La première barre de défilement montre la progression total du protocole programmé et la deuxième, la progression de chaque étape.
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| Fig.2: Mode de travail |
Fig.2: Lorsque vous démarrez la communication avec l'appareil, vous choisissez votre mode de travail "Routine ou Expert" et sélectionnez les chambres avec lesquelles vous voulez travailler.
L'interface du logiciel WinTrayMix™ vous propose quatres procédures d'utilisation en mode "Routine" et cinq en mode "Expert".
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| Fig.3: Configuration des étapes |
Fig.3: Cette interface montre toutes les configurations possibles avec la station d'hybridation et de lavage TrayMix™ S4 (Dénaturation, Pré-hybridation, Hybridation, Lavages et Décontamination). Les protocoles de chaque étape sont paramétrables. Sur la partie gauche, l'opérateur choisi les procédures et sur celle de droite, il entre les paramètres de température et de temps.
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| Fig.4: Etapes de lavages |
Fig.4: Le système permet de programmer jusqu'à 3 étapes de lavages. Il est possible de rappeler "n" fois chaque étape de lavage pour régénérer les tampons de lavage.
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| Fig.5 | Fig.6 |
Fig.5: Toutes les étapes d'une programmation sont visualisables sur la fenètre. A tout moment au cours du process, l'opérateur peut suivre le temps d'avancement de toute la programmation ainsi que l'étape en cours. Pour l'étape d'hybridation un décompte (heures, minutes) apparait entre les barres de progression.
Fig.6: En mode "Expert", le système permet une programmation étape par étape:
La procédure d'Hybridation vous permet de sélectionner, paramètrer et programmer les différentes opérations : la pré-hybridation, une ou plusieurs étapes d'hybridation et les lavages.
La procédure de Décontamination vous permet de lancer le nettoyage et la décontamination automatique du système. Cette procédure doit être réalisée entre chaque procédure d'hybridation un minimum de 3 fois à 60/70°C.
La procédure de Maintenance permet d'initialiser, vider et changer vos réactifs.
La procédure Chronogrammes "Step by Step" en mode expert, permet de faire les étapes une par une pour toutes les procédures. Il est ainsi possible de réaliser une hybridation avec plusieurs palier de temps et de températures différentes.
Rapport d'hybridation : WinTrayMix™ permet d'éditer un rapport d'hybridation.
Le rapport est personnalisé avec les caractéristiques de votre expérience et le logo de votre organisme.
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| Fig.7: Rapport d'hybridation |
Fig.7: Le rapport généré par le logiciel WinTrayMix™ est un fichier HTML que vous pouvez lire avec n'importe quel navigateur web. Il comprend la date à laquelle il a été généré, les données de votre configuration, et résume dans un tableau les opérations effectuées.
Dans ce tableau, seules les opérations que vous avez paramétrées apparaissent : dénaturation, pré-hybridation, hybridations et/ou lavages. Pour chaque opération figurent la date et l'heure de début, la durée paramétrée et la durée réelle de l'opération, la température associée ainsi que le statut de l’opération (terminée, annulée...).
Technologie
Nos stations d'hybridation et de lavage utilisent une technolgie de mélange actif éprouvée et brevetée dont BioTray® est propriétaire. Cette technologie est basée sur un phénomène dit d'Advection Chaotique.
Une étude comparative entre l'hybridation dynamique dite par Advection Chaotique et l'hybridation statique (manuelle) a été realisée et montre les aspects suivants:
• Signal & CV (Coefficient de variation):
Ici la comparaison montre une meilleure intensité du signal en 2 heures avec la station d'hybridation TrayMix™ contre 12 heures en statique (manuel). De plus les coefficients de variation (CV) n'augmentent pas lors d'une hybridation avec la station d'hybridation TrayMix™. Il est de 10% contre 30 % entre lames et lamelles.
Table1: Valeurs moyennes de fluorescence et de coefficient de variation (CV) mesurés sous différentes conditions d'hybridation (2 heures d'hybridation).
| Concentration Echantillon (0.1µM) |
Volume Solution (µl) |
Quantité échantillon (pmol) |
Méthode | Solution d'hybridation | Taux de Fluorescence | CV |
| Hybridation Statique | 50 | 5 | Entre lame et lamelle | Non homogène | 5500 | 0.33 |
| Hybridation Dynamique | 353 | 35 | TrayMix™ | Homongène | 11 823 | 0.17 |
Table 2: Valeurs moyennes de fluorescence et de CV obtenus avec la même quantité de cibles, en statique et en dynamique respectivement (2 heures d'hybridation).
| Quantité Echantillon (5pmole) |
Volume Solution (µl) |
Quantité échantillon 5µg |
Méthode | Solution d'hybridation | Taux de Fluorescence | CV |
| Hybridation Statique | 50 | 0.1 | Entre lame et lamelle | Non homogène | 5500 | 0.33 |
| Hybridation Dynamique | 353 | 0.01 | TrayMix™ | Homongène | 6452 | 0.16 |
NB: Le CV du système après 2 heures d'hybridation est équivalent à celle de l'hybridation manuelle effectuée en 12 heures.
• Rapport Signal /Bruit & pécificité:
La biopuce est hybridée pendant 2 heures avec un ADN simple brun (84 nt) marqué à la Cy3, complémentaire à l'allèle a. Les hybridations ont été effectuées avec 5 pmol de cibles en statique entre lames et lamelles et en dynamique avec le TrayMix™. L'allèle b est utilisé comme contrôle pour la spécificité d'hybridation. Pour chaque expérience, l'intensité des spots est analysée et comparée au bruit de fond local. Les résultats comparent l'intensité du signal de fluorescence Cy3 obtenu au bruit de fond pour l'allèle a (en noir) et l'allèle b (gris) pour trois expériences A+/-SD (Standard de Déviation).
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Cette figure montre que la spécificité du rapport signal / bruit de fond (allèle a - barres noires) est augmentée de 3,5 à 4,2 dans les conditions d'une hybridation dynamique avec le TrayMix™. Le rapport signal / bruit de fond (allèle b - barres grises) est légèrement réduit. Les comparaisons de résultats après 12 heures d'hybridation en statique sont encore plus favorables à la station d'hybridation TrayMix™ (données non représentées). Le mélange actif par advection chaotique améliore les résultats d'hybridation: diminution du temps, homogénéité et meilleur rapport signal / bruit de fond. De plus, l'automatisation de cette étape est cruciale pour une meilleure reproductibilité des résultats. Le système a donc été mis au point en vue d'atteindre des niveaux de reproductibilité indispensables pour le diagnostic. L'advection chaotique offre un avantage encore plus important, comparée à l'hybridation passive, lors de l'utilisation de molécules de haut poids moléculaire pour des applications telles que les CGHarrays.
• Conclusions & Perspectives:
Le TrayMix™ offre une véritable innovation pour augmenter l'efficacité, la sensibilité, la reproductibilité et la robustesse des hybridations. Le port d’injection est conçu pour permettre d’ajouter automatiquement et séquentiellement des petites quantités de nouveaux réactifs pour le traitement de pré ou de post-hybridation (par exemple : réactions enzymatiques, réactions chimiques, réactions sandwich, etc.…). Ceci permet la conception des processus les plus compliqués tels que l'élongation d'Oglio ou les réactions multi-étapes. De plus, la technologie permet l’adaptation à de multiples lames ou de multiples zones sur une même lame. Il doit être noté que la technologie du TrayMix™ est applicable à tous les types de microarrays comme, CHIP on Chip, protéine et peptide, CGH, et FISH. Ce vaste éventail d’applications fait du TrayMix™ un investissement fructueux pour n’importe quel utilisateur de microarrays.
• Support Technique:
Pour toutes questions techniques, veuillez contacter
Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir.
ou par Tel : +33(0)4 27 02 19 83.
Accessoires
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Fig.1: Dans le cadre du nettoyage des stations d’hybridation TrayMix™, des cassettes d’hybridation, ou toute autre partie métallique, BioTray® préconise l’utilisation des tissus TechniCloth®. Ce tissu, imbibé d’eau ultrapure, d’éthanol pur ou dilué, offrira un nettoyage propre, sans contamination et sans peluche sur les surfaces nettoyées.
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| Fig.1 |
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| Fig.2: Tissu TechniCloth |
Fig.2: Le tissu TechniCloth® est un tissu non tissé composé d’un mélange 55% cellulose et 45 % polyester. Cette composition combine les propriétés hautement absorbantes d’une fibre naturelle, la cellulose (bonne absorption d’eau et des liquides), et la résistance d’une fibre synthétique, le polyester (absorption de liquides à base d’huiles et graisses). Développé pour une utilisation en salle blanche en milieu médical ou pharmaceutique, sa structure permet le nettoyage et l’essuyage de surfaces avec une libération minimum de particules contaminantes, et une compatibilité avec de nombreux solvants.
Deux formats vous sont proposés.
• Format 6" x 6" (15 x 15 cm):
Conditionnement: sachet de 600 tissus. Pack de 2 sachets de 300.
•Format 9" x 9" (23 x 23 cm).
Conditionnement: sachet de 300 tissus. Pack de 2 sachets de 150.
Joints d'étanchéités:
Pour assurer une efficacité optimale de la chambre d'hybridation en prévision de l'usure des joints d'étanchéité, BioTray® fournit un jeu de 12 joints toriques en élastomère.
Un joint torique est une boucle d'un élastomère avec une section de forme circulaire.
| Référence | Description |
| TX 606- TechniCloth® | Tissus de nettoyage pour chambre d'hybridation. Format : 6’’x 6’’ (15 cm x 15 cm) Conditionnement : sachet de 600 tissus ; pack contenant 2 sachets de 300 tissus chacun. |
| TX 609- TechniCloth® | Tissus de nettoyage pour chambre d'hybridation. Format : 9’’x 9’’ (23 cm x 23 cm) Conditionnement : sachet de 300 tissus ; pack contenant 2 sachets de 150 tissus chacun. |
| JT-FKM | Joint d'étanchéité: Ø 49,9 mm x 1,78 mm - Pack de 12 joints. |
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