TrayMix S4

TrayMixTM S4

Station d'hybridation automatisée

Description

Optimisez hybridations et lavages
Diminuer les coûts et les temps d'analyse
Augmentez la qualité et la reproductibilité de vos résultats.

La station d'hybridation TrayMix S4 est un système de micro mélangeur basé sur une technologie Breveté de mélange par Advection Chaotique dont BioTray®est propriétaire.

De meilleurs résultats sont obtenus par une dispersion homogène des molécules sur l'ensemble de la zone d'hybridation (21 x 60 mmm). Le système réduit de façon significative les temps d'hybridation, tout en offrant des résultats reproductibles et fiables d'une expérimentation à une autre et en utilisant de faible quantités de cibles (5pmole) marquées ou non.

Une plus grande spécificité d'hybridation est atteinte (forte réduction des bruits de fond, intensification de la fluorescence) tout en réduisant de moitié le coefficient de variation (CV). Tous les phénomènes fluidiques tels que les zones mortes et les bulles que l'on peut trouver avec le systèmes classiques actuels sont supprimés afin de vous permettre de réussir toutes vos hybridations en un seul protocole.

Grace à son logiciel de pilotage intuitif et simple d'utilisation, le WinTrayMix, le système ne nécessite pas de mains d'experts. L'interface graphique permet de réaliser toutes les étapes anté et post-hybridation: pré-hybridation, hybridation et lavages. Pour plus d'éfficacité deux modes de travail sont proposés: mode routine pour les hôpitaux et mode expert pour les laboratoires de recherche. La station d'hybridation TrayMix S4 permet aussi d'effectuer des opérations de dénaturation.

Les apports majeurs en comparaison avec la station d'hybridation 2 lames sont les suivants:
  • Réduction de la boucle microfluidique: 250µl contre 513µl. Cette réduction permet d'augmenter les spécificités d'hybridation (réduction du bruit de fond et intensification de la fluorescence).
  • Meilleur régulation de température: (+/- 0,1°C)
  • Procédure de dénaturation.
  • Possibilité de réaliser différentes températures dans l'étape d'hybridation (Mode Expert).
Avec la station d'hybridation TrayMix S4, améliorez vos résultats d'analyses pour l'expression de gènes, la détection de mutations, l'hybridation Génomique Comparative (CGH), le génotypage, l'hybridation fluorescente (FISH ou fluorescent in situ hybridization), et plus encore...
 
Référence Description
HS-TMX_S4 Station d'hybridation pour biopuces TrayMix S4 (4 lames).
Un an de garantie pièce et main d'oeuvre.
Un an de mise à jour du logiciel WinTrayMix, Support technique.

Télécharger la brochure TrayMix™ S4

Spécifications

La température est régulée de l'ambiante à 75°C +/- 0,1°C permettant de réaliser des étapes de dénaturation. En amont de la boucle microfluidique et de la chambre d'hybridation, un collecteur à 5 voies distribue les solutions sélectionnées auparavant par la programmation.

Les étapes de dénaturation, de pré-hybridation, d'hybridation, de lavages et de décontamination sont toutes programmables.
L'étape de séchage se fait en dehors du système avec notre mini centrifugeuse. La force centrifuge est le système le plus performant pour éliminer l'humidité résiduelle, permettant d'obtenir des résultats de qualité. L'utilisation de gaz à sec a précisément été évités pour supprimer la formation de taches causées par le séchage des lames avec les gaz sous pression.

 Dimensions: L x P x H  52,6 x 46,5 x 21 cm
 Poids:  19 Kg
 Capacité:  4 lames. Pilotage indépendant ou simultané.
 Zone d'hybridation:  21 x 60 mm
 Volume d'hybridation:  Chambre d'hybridation: 60 µl
 Boucle microfluidique: 250 µl
 Système fluidique:  Manifold + chambre + capillaires.
 Chimiquement résistant et compatible avec tous réactifs.
 Cible biologique:  5 à 50 pmoles injectées à la pipette.
 Echantillon:  5 µl à 60 µl
 Température:  25° à 75°C (+/-0,1°C)
 Programmation:  Logiciel WinTrayMix.
 (Programmation et pilotage des éléments fluidiques).
 Système d'exploitation: Windows XP & Vista.
 Modes de programmation: Routine & Expert.
 Logiciel WinTrayMix  Sauvegarde et téléchargement des protocoles.
 6 procédures automatiques et programmables: Dénaturation, Pré-hybridation, Hybridation, Lavages et Décontamination.
 Modes d'exécution des programmes: routine & expert.
 Traçabilité des opérations et éditon d'un rapport complet au format HTML.

 

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Fig.1: 4 Chambres d'hybridation

Fig.1: La station d'hybridation TrayMix S4 dispose de 4 chambres totalement indépendantes. Ainsi elles peuvent être programmées pour exécuter le même protocole ou des protocoles totalement différents, pilotés grâce au logiciel WinTrayMix. Cette flexibilité permet à l'opérateur d'effectuer différentes hybridations sur chaque chambre.

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Fig.2: Insertion de la lame Fig.3: Fermeture de la chambre

Fig.2 & Fig.3: Une fois le système programmé et la biopuce insérée, le tampon d’hybridation est automatiquement acheminé dans la chambre d'hybridation qui est composée d'une plate-forme sur laquelle est positionnée la lame et d’une chambre d’une hauteur de 50 µm. Le volume de la chambre est fixé mécaniquement assurant ainsi le même volume sur toutes les chambres. Le joint en élastomère perfluoré assure uniquement l'étanchéité de la chambre sur le lame.
 

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Fig.4: Bouchon Fig.5: Port d'injection

Fig.4 & Fig.5: Le trou d'injection est situé à l'exterieur de la chambre, directement dans la boucle microfluidique. Ce sytème assure un mélange rapide et plus homogène. La station d'hybridation TrayMix S4 permet de réaliser toutes les étapes suivantes automatiquement (Dénaturation, Pré-hybridation, Hybridation, Lavages et Décontamination).
Le système permet aussi de programmer plusieurs phases avec des températures et temps différents.
Après chaque protocole, un système automatisé permet de décontaminer la chambre et le sytème fluidique.

Logiciel


WinTrayMix est un logiciel complet qui allie puissance et simplicité d'utilisation avec une interface très intuitive. Conçu pour les utilisateurs de microarrays, il offre les fonctionnalités suivantes:

  • Deux modes de programmation: mode routine pour les hôpitaux et expert pour les laboratoires de recherche.
  • Sauvegarde des protocoles pour une utilisation ultérieure
  • Indépendance des différentes étapes: Dénaturation, Pré-Hybridation, Hybridation, Lavages et décontamination du système. Les étapes peuvent être réalisées en continue ou étape par étape.
  • Traçabilité des opérations et édition d'un rapport complet au format HTML.
Fig.1: Interface d'accueil

Fig.1: Interface d'accueil. L'interface d'accueil montre toutes les chambres de la station d'hybridation. Il est possible de choisir le nombre de chambres à programmer. L'opérateur a ainsi le choix de travailler en mode routine ou expert avant de paramètrer les protocoles d'hybridation. La première barre de défilement montre la progression total du protocole programmé et la deuxième, la progression de chaque étape.

 
 Fig.2: Mode de travail

Fig.2: Lorsque vous démarrez la communication avec l'appareil, vous choisissez votre mode de travail "Routine ou Expert" et sélectionnez les chambres avec lesquelles vous voulez travailler.
L'interface du logiciel WinTrayMix vous propose quatres procédures d'utilisation en mode "Routine" et cinq en mode "Expert".

Fig.3: Configuration des étapes

Fig.3: Cette interface montre toutes les configurations possibles avec la station d'hybridation et de lavage TrayMix S4 (Dénaturation, Pré-hybridation, Hybridation, Lavages et Décontamination). Les protocoles de chaque étape sont paramétrables. Sur la partie gauche, l'opérateur choisi les procédures et sur celle de droite, il entre les paramètres de température et de temps.

Fig.4: Etapes de lavages

Fig.4: Le système permet de programmer jusqu'à 3 étapes de lavages. Il est possible de rappeler "n" fois chaque étape de lavage pour régénérer les tampons de lavage.

Fig.5 Fig.6

Fig.5: Toutes les étapes d'une programmation sont visualisables sur la fenètre. A tout moment au cours du process, l'opérateur peut suivre le temps d'avancement de toute la programmation ainsi que l'étape en cours. Pour l'étape d'hybridation un décompte (heures, minutes) apparait entre les barres de progression.

Fig.6: En mode "Expert", le système permet une programmation étape par étape:

La procédure d'Hybridation vous permet de sélectionner, paramètrer et programmer les différentes opérations : la pré-hybridation, une ou plusieurs étapes d'hybridation et les lavages.

La procédure de Décontamination vous permet de lancer le nettoyage et la décontamination automatique du système. Cette procédure doit être réalisée entre chaque procédure d'hybridation un minimum de 3 fois à 60/70°C.

La procédure de Maintenance permet d'initialiser, vider et changer vos réactifs.


La procédure Chronogrammes "Step by Step" en mode expert, permet de faire les étapes une par une pour  toutes les procédures. Il est ainsi possible de réaliser une hybridation avec plusieurs palier de temps et de températures différentes.

Rapport d'hybridation : WinTrayMix permet d'éditer un rapport d'hybridation.
Le rapport est personnalisé avec les caractéristiques de votre expérience et le logo de votre organisme.

Fig.7: Rapport d'hybridation

Fig.7: Le rapport généré par le logiciel WinTrayMix est un fichier HTML que vous pouvez lire avec n'importe quel navigateur web. Il comprend la date à laquelle il a été généré, les données de votre configuration, et résume dans un tableau les opérations effectuées.
Dans ce tableau, seules les opérations que vous avez paramétrées apparaissent : dénaturation, pré-hybridation, hybridations et/ou lavages. Pour chaque opération figurent la date et l'heure de début, la durée paramétrée et la durée réelle de l'opération, la température associée ainsi que le statut de l’opération (terminée, annulée...).

Technologie


Nos stations d'hybridation et de lavage utilisent une technolgie de mélange actif éprouvée et brevetée dont BioTray® est propriétaire. Cette technologie est basée sur un phénomène dit d'Advection Chaotique.
Une étude comparative entre l'hybridation dynamique dite par Advection Chaotique et l'hybridation statique (manuelle) a été realisée et montre les aspects suivants:

Signal & CV (Coefficient de variation):
Ici la comparaison montre une meilleure intensité du signal en 2 heures avec la station d'hybridation TrayMix contre 12 heures en statique (manuel). De plus les coefficients de variation (CV) n'augmentent pas lors d'une hybridation avec la station d'hybridation TrayMix. Il est de 10% contre 30 % entre lames et lamelles.

Table1: Valeurs moyennes de fluorescence et de coefficient de variation (CV) mesurés sous différentes conditions d'hybridation (2 heures d'hybridation).

Concentration
Echantillon (0.1µM)
Volume
Solution (µl)
Quantité
échantillon (pmol)
Méthode Solution d'hybridation Taux de Fluorescence CV
Hybridation Statique 50 5 Entre lame et lamelle Non homogène 5500 0.33
Hybridation Dynamique 353 35 TrayMix Homongène 11 823 0.17


Table 2: Valeurs moyennes de fluorescence et de CV obtenus avec la même quantité de cibles, en statique et en dynamique respectivement (2 heures d'hybridation).
 

Quantité
Echantillon (5pmole)
Volume
Solution (µl)
Quantité
échantillon 5µg
Méthode Solution d'hybridation Taux de Fluorescence CV
Hybridation Statique 50 0.1 Entre lame et lamelle Non homogène 5500 0.33
Hybridation Dynamique 353 0.01 TrayMix™ Homongène 6452 0.16

NB: Le CV du système après 2 heures d'hybridation est équivalent à celle de l'hybridation manuelle effectuée en 12 heures.

• Rapport Signal /Bruit & pécificité:
La biopuce est hybridée pendant 2 heures avec un ADN simple brun (84 nt) marqué à la Cy3, complémentaire à l'allèle a. Les hybridations ont été effectuées avec 5 pmol de cibles en statique entre lames et lamelles et en dynamique avec le TrayMix. L'allèle b est utilisé comme contrôle pour la spécificité d'hybridation. Pour chaque expérience, l'intensité des spots est analysée et comparée au bruit de fond local. Les résultats comparent l'intensité du signal de fluorescence Cy3 obtenu au bruit de fond pour l'allèle a (en noir) et l'allèle b (gris) pour trois expériences A+/-SD (Standard de Déviation).

Cette figure montre que la spécificité du rapport signal / bruit de fond (allèle a - barres noires) est augmentée de 3,5 à 4,2 dans les conditions d'une hybridation dynamique avec le TrayMix. Le rapport signal / bruit de fond (allèle b - barres grises) est légèrement réduit. Les comparaisons de résultats après 12 heures d'hybridation en statique sont encore plus favorables à la station d'hybridation TrayMix (données non représentées). Le mélange actif par advection chaotique améliore les résultats d'hybridation: diminution du temps, homogénéité et meilleur rapport signal / bruit de fond. De plus, l'automatisation de cette étape est cruciale pour une meilleure reproductibilité des résultats. Le système a donc été mis au point en vue d'atteindre des niveaux de reproductibilité indispensables pour le diagnostic. L'advection chaotique offre un avantage encore plus important, comparée à l'hybridation passive, lors de l'utilisation de molécules de haut poids moléculaire pour des applications telles que les CGHarrays.

• Conclusions & Perspectives:
Le TrayMix offre une véritable innovation pour augmenter l'efficacité, la sensibilité, la reproductibilité et la robustesse des hybridations. Le port d’injection est conçu pour permettre d’ajouter automatiquement et séquentiellement des petites quantités de nouveaux réactifs pour le traitement de pré ou de post-hybridation (par exemple : réactions enzymatiques, réactions chimiques, réactions sandwich, etc.…). Ceci permet la conception des processus les plus compliqués tels que l'élongation d'Oglio ou les réactions multi-étapes. De plus, la technologie permet l’adaptation à de multiples lames ou de multiples zones sur une même lame. Il doit être noté que la technologie du TrayMix est applicable à tous les types de microarrays comme, CHIP on Chip, protéine et peptide, CGH, et FISH. Ce vaste éventail d’applications fait du TrayMix un investissement fructueux pour n’importe quel utilisateur de microarrays.

• Support Technique:
Pour toutes questions techniques, veuillez contacter Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir. ou par Tel : +33(0)4 27 02 19 83.

Accessoires

Tissus de nettoyage
 
Fig.1: Dans le cadre du nettoyage des stations d’hybridation TrayMix, des cassettes d’hybridation, ou toute autre partie métallique, BioTray® préconise l’utilisation des tissus TechniCloth®. Ce tissu, imbibé d’eau ultrapure, d’éthanol pur ou dilué, offrira un nettoyage propre, sans contamination et sans peluche sur les surfaces nettoyées.
Fig.1
 
Fig.2: Tissu TechniCloth

Fig.2: Le tissu TechniCloth® est un tissu non tissé composé d’un mélange 55% cellulose et 45 % polyester. Cette composition combine les propriétés hautement absorbantes d’une fibre naturelle, la cellulose (bonne absorption d’eau et des liquides), et la résistance d’une fibre synthétique, le polyester (absorption de liquides à base d’huiles et graisses). Développé pour une utilisation en salle blanche en milieu médical ou pharmaceutique, sa structure permet le nettoyage et l’essuyage de surfaces avec une libération minimum de particules contaminantes, et une compatibilité avec de nombreux solvants.

Deux formats vous sont proposés.
• Format 6" x 6" (15 x 15 cm):
Conditionnement: sachet de 600 tissus. Pack de 2 sachets de 300.
•Format 9" x 9" (23 x 23 cm).
Conditionnement: sachet de 300 tissus. Pack de 2 sachets de 150.


Joints d'étanchéités:

Pour assurer une efficacité optimale de la chambre d'hybridation en prévision de l'usure des joints d'étanchéité, BioTray® fournit un jeu de 12 joints toriques en élastomère.
Un joint torique est une boucle d'un élastomère avec une section de forme circulaire.
 

Référence Description
TX 606- TechniCloth® Tissus de nettoyage pour chambre d'hybridation.
Format : 6’’x 6’’ (15 cm x 15 cm)
Conditionnement : sachet de 600 tissus ; pack contenant 2 sachets de 300 tissus chacun.
TX 609- TechniCloth® Tissus de nettoyage pour chambre d'hybridation.
Format : 9’’x 9’’ (23 cm x 23 cm)
Conditionnement : sachet de 300 tissus ; pack contenant 2 sachets de 150 tissus chacun.
JT-FKM Joint d'étanchéité: Ø 49,9 mm x 1,78 mm - Pack de 12 joints.